• Kuvendi
• Kryetari
• Këshilli drejtues
• Këshilli mbikqyrës
• Këshilli etik
• Gjyqi i nderit
• Prokurori
• Komisionet e përhershme

Mandati i anëtarëve të organeve të Odës së Mjekëve të Kosovës është katër vjet, me të drejtë të rizgjedhjes edhe për një mandat tjetër katër vjecar.